基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子

何平, 李林光*, 王海波, 常源升
山东省果树研究所, 山东泰安271000

通信作者:李林光;E-mail: llg6536@163.com

摘 要:

桃(Prunus persica)是我国重要的果树树种之一, 其果皮色泽是重要的外观品质。本研究以同期成熟的红色桃‘秋雪’和白里‘肥桃’为试材, 基于Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台, 采用RNA-seq技术比较分析两个品种桃果实不同发育时期转录组数据。测序共产生16.59 Gb Clean Data测序数据, 基于有参或无参转录组序列组装法获得30 211个Unigene, 其中3 060个差异表达基因在Nr、 Swissprot、 GO、 COG和KEGG数据库中得到功能注释。在这些注释的差异基因当中有6个KEGG通路得到显著富集, 其中包括类黄酮合成通路和光合通路。差异基因与植物转录因子数据库比对, 筛选到153个差异表达基因分属于32个转录因子家族, 其中包括已报道的参与调控花青苷合成的MYB和bHLH两类转录因子家族。进一步对花青苷代谢途径中的类黄酮合成通路中的关键酶基因进行q-PCR分析发现, CHSCHIF3H在‘肥桃’和‘秋雪’桃中表达方式很相似, 但DFR、ANS和UFGT表达模式上存在较大差别, 尤其是UFGT基因。通过果皮花青苷含量检测分析发现, ‘秋雪’桃与‘肥桃’果皮中花青苷含量变化趋势与UFGT基因的表达模式一致。本研究结果有助于阐明桃不同果皮色泽分子遗传差异, 为揭示其调控机制奠定基础。

关键词: 桃; 转录组; 转录因子; 果皮色泽; 花青苷

收稿:2018-12-13   修定:2019-01-23

资助:现代农业产业技术体系(CARS-30-Z-08)、山东省农业重大应用技术创新课题(2014-38)和山东省农业科学院农业科技创新工程(CXGC2016B07)

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